فى تدوينة بتاريخ 27 أبريل 2013، فى أثناء وجود محمد مرسى فى السلطة، تقول آيات عرابى: "رئيس لا يدرك ألف باء الديمقراطية ولا يصلح رئيسا لمصر".
وفى تدوينة لاحقة، قالت آيات عرابى بتاريخ 20 أغسطس 2013، أى بعد فض اعتصام أنصار الرئيس المعزول فى رابعة العدوية: "مرسى كان رئيسا فاشلا واتبع سياسة فاشلة ولم يستطع احتواء كل المعارضين".
وتكشف تدوينات أخرى لآيات عرابى عن أنها اتخذت موقفا معاديا لحازم صلاح أبو إسماعيل فى أثناء أزمة استبعاده من الانتخابات الرئاسية 2012، بسبب حصول والدته على الجنسية الأمريكية، إذ وصفته بالكذاب، وقالت بتاريخ 21 أبريل 2012: "الشيخ طارق يوسف أول من شهد فى موضوع جنسية أم حازم فى لقاء حصرى معى، يقول: أقسم بالله إنك يا حازم كذاب، وأنا أقول إن أم حازم تحمل الجنسية الأمريكية وبالأوراق والمستندات المختومة.. قريبا".
وفى سياق متصل، كانت آيات عرابى قد هاجمت الداعية الإخوانى وجدى غنيم والدعاة المحسوبين على الإخوان فى أثناء إجراء الانتخابات الرئاسية 2012، إذ قالت فى 16 مايو من العام نفسه: "لما المشايخ المشبوهين إياهم، اللى كل يوم يقرفونا بفتاويهم التى ليس لها معنى ولا تدل على شىء، إلا على جهل بتعاليم الدين، الذى يحث على المشورة والموعظة ليس بالفتاوى والترهيب من استخدام عقولنا وإرادتنا، فبعد الشيخ إياه الذى قال إن لم تنتخب مرسى سيقرصك الثعبان فى القبر 4 سنين، يعنى بحسبة بسيطة هتتقرصوا بعدد سنين خدمة الرئيس فى السلطة، ولو خدم 8 سنين يبقى يا ويلكم من التعابين، وبعد هذا يظهر المدعو وجدى غنيم ليقول إن انتخاب مرسى واجب دينى، الله يلعنكم بحق كل واحد بتحاولوا تضللوه بأفكاركم".
