وتأتى هذه الخطة للعمل على مواجهة تحديات الموارد المائية الحالية والمستقبلية فى مصر وذلك من خلال أربع محاور أساسية تعمل على تنمية موارد مائية إضافية، وترشيد الاستخدامات المائية فى كافة القطاعات المستخدمة لها، وتحسين نوعية المياه والحفاظ عليها من التلوث، مع تهيئة البيئة المناسبة لتنفيذ الخطة من خلال الإجراءات التشريعية والمؤسسية والتنسيقية المطلوبة.
الجدير بالذكر أن مشروع الخطة القومية للموارد المائية يهدف كذلك إلى وضع خطط محلية للموارد المائية فى خمس محافظات هى قنا والفيوم والبحيرة ودمياط وكفر الشيخ. ثم قام قطاع التخطيط بالتوسع فى وضع خطط الموارد المائية بالمحافظات ليشمل كافة محافظات الجمهورية.